江苏省农业科学院食品质量安全与检测研究所，是于2002年组建的公益性科学研究机构。内设农产品安全研究室、分子技术与生物安全研究室、产地质量与投入品安全研究室、畜禽产品安全研究室、安全溯源与预警研究室。研究领域涉及农畜产品产地环境质量监测评价；安全生产规范及质量体系研究；农畜产品安全质量标准与生物筛选确证检测；农业投入品安全评价与开发利用研究；食品及环境生态安全风险评估研究；转基因生物安全检测与评价研究；植物源及生物工程技术投入品研发；食品安全溯源与预警技术研究等。研究对象涉及农产品、畜禽产品、农田生态环境样品及部分加工食品中的重金属、农兽药、转基因组分、毒素及其他有毒、有害物质。
该所现建有“中美食品安全联合研究中心”、“农业部食品安全监控重点开放实验室”、“省部共建国家重点实验室培育基地——江苏省食品质量安全重点实验室”、“江苏省畜禽产品安全重点实验室”、“国家农业科技华东（江苏）创新中心——江苏省农产品安全重点实验室”，以及“江苏省转基因安全评价检测公共技术服务中心”、“江苏省质量技术监督食用油检验站”等公共服务平台。2003年通过省级计量认证，是农业无公害农产品基地认定检测单位。
该所现有编制内职工35人，其中研究员5名，副研究员15名，博士19名。此外，常年有20多名（博、硕士）研究生在所内从事学术研究。自成立以来，该所先后承担国家食品安全重大专项、国家转基因重大专项、国家自然科学基金、国家农业科技支撑计划、国家公益性农业行业科研专项、973前期预研、863、农业部948等一批重点课题，主持获得江苏省科技进步二、三等奖各2项，32项专利获授权，发表200余篇研究论文，其中被SCI源期刊收录论文40余篇。
该所参照国家开放实验室的管理要求，按照国家计量认证质量管理体系运行，正大力加强单位人才队伍和软硬件条件建设，不断深化“人尽其才、和谐奋进”的理念，强化“严谨治学、务实求真”的工作作风，努力争创“国际先进、国内一流”的食品安全与检测研究所。