近年来，南京市市场监管局在市委市政府和省市场监管局的正确领导下，以机构改革为契机，将知识产权工作融入市场监管体系，不断拓展知识产权工作领域和空间，发挥体制机制优势，全力打造知识产权保护最严格城市。
一是政策引领高位推进，构建知识产权工作新格局。为贯彻打造全国知识产权保护最严格城市要求，南京市先后发布实施《南京市知识产权战略纲要》《南京市知识产权促进与保护条例》，知识产权工作连续两年写入市委一号文件，市政府建立了知识产权联席会议制度，成立以市长为组长的市知识产权强市建设工作领导小组，与江苏省知识产权局建立了省市共建知识产权强市会商机制，高位协调推进相关工作。2018年，南京市获批国家知识产权运营服务体系建设重点城市，一年多来，通过增设知识产权法庭巡回审判点、设立综合服务窗口等措施，逐渐形成集知识产权创造、保护、运用、服务、人才多位一体的知识产权工作格局。
二是强化力量配置，努力打造知识产权体制新优势。在此次机构改革中，南京市加大了知识产权工作力量配置，保留了知识产权局牌子，同时整合商标和原产地地理标志、集成电路布图登记等职能，统一管理。南京市局设立了知识产权战略推进处等4个处室，市级部门专门从事知识产权工作的行政和事业总编制数近70个，实有人数达到58人，处室数量、配备的力量和规模全省第一，位于副省级城市前列。
三是激发知识产权创新活力，助力南京高质量发展。南京市局着力提升以核心专利为支撑的技术质量、产品质量，以高价值商标为代表的品牌质量，及时修订了《高水平建设国家知识产权强市实施办法》《南京市知识产权公共服务平台培育管理办法》，通过加强专利代理机构监管，实地检查列入异常名录机构，严查挂证执业等行为，从政策层面杜绝低质量非正常专利产生；将有效发明专利量和PCT申请量两项知识产权核心指标纳入市对区考核；目前，市级23家高价值专利培育中心进入实质建设，84件优秀专利申报国家和省专利奖。上半年，南京市专利申请和专利授权增幅、企业专利申请和授权增幅、发明专利授权量、万人发明专利拥有量6项指标居全省第一，万人有效发明专利拥有量63.31件，居全国第三。其中，PCT专利申请275件，同比增长26.2%。商标申请26324件，同比增长6.3%，商标注册27791件，同比增长57.4%，有效注册商标239706件，同比增长12.5%。
四是构建知识产权运营服务新体系，助力创新名城建设。为助力南京创新名城建设，制定并实施《南京市知识产权运营服务体系建设实施方案》，强化多平台体系建设，与三家知识产权特色公共服务平台签订年度目标任务，提升平台服务能力，上半年，全市专利质押融资金额达7亿元。进一步优化企业服务，至5月底，南京窗口累计受理商标注册申请1518件，覆盖北上广深、东三省及海南等多省市；上半年全市备案知识产权贯标企业145家，推荐50家企业申报省战略推进计划项目。完善知识产权人才培养体系，按品牌化、专业化、精准化原则，举办第19期企业家知识产权高层研修班等培训。
五是发挥综合监管优势，提高知识产权保护新水平。南京市局构建了多位一体的知识产权大保护框架，建设优势产业专利申请快速预审通道，加快审查专利346件，备案入库企业529家。南京海关、市法院、仲裁委等8个单位均在保护中心设点。加大执法力度，全市上半年查处受理假冒专利和专利侵权案件75件，有力净化了市场环境。加强宣传，举办4.26世界知识产权日等系列活动，连续17年双语发布《2018年南京市知识产权保护状况》白皮书，评选2018南京市知识产权十件大事。中国（南京）知识产权保护中心与南京知识产权法庭、市检察院等8家单位签订协同保护战略合作协议，初步形成协同保护的架构。